数理モデルと時系列データの解析

時系列データから数理モデルのパラメータを推定するのに必要な技術・知識をまとめます。


BrdUラベリングデータとターンオーバーの推定

【R tips】MonolixのモデルファイルからRのodeで計算するためのコードを生成する

MonolixのプロットがよろしくないのでRでプロットを作成したい。

更新:2023年10月03日 | 投稿:2023年10月03日

【R tips】多次元正規分布から乱数を生成する

多次元正規分布から乱数を生成しようと思ったけど、複数の正規分布と多次元正規分布は違うらしい。

更新:2020年11月12日 | 投稿:2020年11月12日

【R tips】formatC()を使って論文に必要な有効数字3桁を取得する

Rで計算した数字を出力したいときに強制的に数字を浮動小数点表記(floating point expression)にします。

更新:2020年02月26日 | 投稿:2020年02月25日

【R tips】テキストファイルで準備したデータをread.csv()で読み込む

テキストファイルで準備したデータを、ファイルを指定してread.csv()で読み込み、成形する方法です。

更新:2020年02月20日 | 投稿:2020年02月19日

【R tips】相対パス、ルートパス、ホームディレクトリなど

プログラミングをする上で必要なパス、ディレクトリの基本です。

更新:2020年02月20日 | 投稿:2020年02月19日

【R tips】ggplot2でラベルを好きな順番に並べる方法

ggplot2で色分けなどにつかったラベルをレジェンドに表示すると文字順にソートされるので、これを回避する方法。

更新:2020年02月17日 | 投稿:2020年02月16日

生物数学の理論とその応用のまとめ

毎年開催されている生物数学の理論とその応用 -Theory of BioMathematics and its Application-の情報をまとめました。

更新:2019年12月17日 | 投稿:2019年12月16日

Rの基本

Rの基本操作などをまとめています。

更新:2019年11月13日 | 投稿:2019年11月12日

数理モデルと時系列データの解析

時系列データから数理モデルのパラメータを推定するのに必要な技術・知識をまとめます。

更新: | 投稿:2019年11月12日

Rでの時系列データの準備

Rで時系列データを解析に使うための準備や読み込みの方法、データ形式などについてまとめています。

更新:2019年11月12日 | 投稿:2019年11月12日

BrdUラベリングの時系列データからパラメータ推定

ウイルス感染と常微分方程式 (シリーズ・現象を解明する数学)の中で紹介されている、BrdUラベリングデータから常微分方程式で記述された数理モデルのパラメータを推定する方法

更新:2019年11月12日 | 投稿:2019年11月11日