【R tips】MonolixのモデルファイルからRのodeで計算するためのコードを生成する
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アイデアメモ
model.txt
みたいなのを読み込んで、微分を定義するode.c
とパラメータを受け取ってdeSolve()
のode()
関数に渡すコードode.R
を生成したい。- 文字列処理で書けば良い
- 様々な要素を考慮
- パラメータ
- regressor
- if文
populationParameter.txt
とestimatedIndividualParameters.txt
を受け取ってプロット- 自由に分割
- 色を指定
- 大きさを指定
- 基本的にMonolixのプロットパネルを参考に設計したら良い?
- OUTPUTも結合したい場合がある
- Use your own model - Monolix
- Simulxを使えば良い!
- https://simulx.lixoft.com/simulx-api/
- https://simulx.lixoft.com/simulx-api/examples/
技術メモ
writeLines()
readLines()